2006年，為配合NDS版（鉆石、珍珠版）的上市，TV動畫同步推出全新系列《神奇寶貝鉆石&珍珠》（Pokémon Diamond & Pearl，簡稱DP）。對戰(zhàn)開拓區(qū)篇結束后，小遙為了獨自挑戰(zhàn)城都地區(qū)的華麗大賽和小智告別，小勝回到了橙華道館，小剛也回家去了。小智則受到了小茂的激勵，獨自帶著皮卡丘和偷渡的長尾怪手前往神奧地區(qū)挑戰(zhàn)聯盟。　　新登場的女主角小光，其藍本取自電玩NDS版。為了成為頂尖協調訓練家，小光從家鄉(xiāng)雙葉鎮(zhèn)來到了位于真砂鎮(zhèn)的山梨研究所領取最初的神奇寶貝。而同一時間，小智也抵達神奧地區(qū)，并在那里和小剛再度會合。機緣巧合，小光救了被火箭隊抓走的皮卡丘，三人就一同結伴旅行，展開了新的旅程。　　《神奇寶貝珍珠&鉆石》每周四在日本首播。臺灣也由中視進行轉播，網絡上能夠找到前105集的國語配音。

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• 更新至05集

  最弱技能《果實大師》～關于能無限食用技能果實（吃了就會死）這件事～

  永冢拓馬,Lynn,三川華月,集貝花,關根明良,大原沙耶香,加隈亞衣,寶龜克壽,子安武人

• 更新至14集

  航海王魚人島篇特別編輯版

  田中真弓,岡村明美,中井和哉,山口勝平,平田廣明,大谷育江,山口由里子,矢尾一樹,長島雄一,寶龜克壽

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